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科研写作与文献管理

写作工具服务于两个阶段:快速形成可评论的内容,以及稳定生成可投稿的论文。早期不必被排版拖慢,进入正式稿后则要让正文、引用、表格和图都可追溯。

Markdown

Markdown 适合 README、实验日志、设计文档和早期大纲。标题表达层级,列表表达并列,表格只承载较短结构;复杂图表和公式可以链接源文件或交给 LaTeX。

文档中的命令应能复制执行,代码块标注语言,链接使用稳定来源。把决策、失败尝试和验证结果写下来,比保存聊天截图更容易搜索和维护。

LaTeX

LaTeX 适合论文结构、数学公式、交叉引用和参考文献。正文关注语义,样式服从会议模板;不要用大量手工空格和负间距“修”版式。

latex
As shown in Figure~\ref{fig:overview}, our method improves
the strongest baseline by $3.2\%$.

\begin{figure}[t]
  \centering
  \includegraphics[width=\linewidth]{figures/overview.pdf}
  \caption{Overview of the proposed method.}
  \label{fig:overview}
\end{figure}

使用 latexmk 或项目提供的单条命令完整编译;提交前清理未定义引用、重复 label、缺失文献和编译警告。图片优先 PDF/SVG 等矢量格式,位图确认分辨率。

Overleaf

Overleaf 降低多人协作和模板编译门槛。主文件、章节、图表和自定义命令应有清晰目录;评论用于讨论,已决定的结论进入正文或项目记录。

重要节点下载源码或同步到 Git,避免在线项目成为唯一副本。大量生成文件、数据分析和图像处理仍应在代码仓库完成,再把最终产物引入论文。

Google Docs

Google Docs 适合提纲、逐句评论、作者分工和非 LaTeX 合作者。使用标题样式和建议模式,避免用颜色暗示长期语义。转入 LaTeX 时先冻结一版结构,明确谁负责迁移,减少两边同时修改造成的分叉。

Zotero

Zotero 用于收集元数据、PDF、笔记和引用。导入后核对作者、标题、Venue、年份和 DOI;网页自动抓取并不保证元数据正确。

建立少量稳定 Collection 和标签,不按每次检索复制一套目录。使用 Better BibTeX 等扩展时固定 citation key 规则,并把导出的 .bib 纳入论文仓库;不要把付费或受限 PDF 未经许可公开。

推荐协作流

  1. Markdown 或 Google Docs 形成叙事和分工。
  2. Zotero 维护文献事实与引用。
  3. LaTeX/Overleaf 形成正式论文。
  4. 图表由代码生成,源数据和脚本留在研究仓库。
  5. 每个投稿节点保存源码、编译 PDF 和对应 Git 版本。

参考:Markdown 指南LaTeX ProjectOverleaf 文档Zotero 文档